10分文章中的RNA pull-down如何七十二變

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長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的RNA分子，它們并不編碼蛋白，而是以RNA的形式在多種層面上（表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等）調(diào)控基因的表達(dá)水平。近年來的研究表明，lncRNA參與了細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡、免疫應(yīng)答以及發(fā)育等多個(gè)生物學(xué)過程。在腫瘤細(xì)胞中，某些特定的lncRNA的表達(dá)水平會(huì)發(fā)生改變，這種表達(dá)水平的變化能夠作為癌癥診斷的標(biāo)志物（有時(shí)是非常靈敏的診斷標(biāo)志物，如前列腺癌中的DD3）和潛在的藥物靶點(diǎn)。



雖然近年來關(guān)于lncRNA的研究進(jìn)展迅猛，但是絕大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的。因此lncRNA的研究是一片非常廣闊的未知領(lǐng)域，具有極大的科研價(jià)值和意義，其中RNA Pull-down技術(shù)為lncRNA生物學(xué)功能的驗(yàn)證起到了至關(guān)重要的作用。RNA Pull-down結(jié)合了體外轉(zhuǎn)錄與生物素標(biāo)記、質(zhì)譜技術(shù)，是研究非編碼RNA與蛋白質(zhì)相互作用的一大利器。



最近發(fā)表在Cancer Res（IF 9.122） 以及HEPATOLOGY（IF 13.246）雜志上的2篇文章：“MetaLnc9 Facilitates Lung CancerMetastasis via a PGK1-Activated AKT/mTOR Pathway”以及“Long Noncoding RNA TSLNC8 Is aTumor Suppressor That Inactivates the Interleukin-6/STAT3 Signaling Pathway”，都是采用RNA Pull-down結(jié)合體外轉(zhuǎn)錄、生物素標(biāo)記和質(zhì)譜技術(shù)來研究lncRNA在腫瘤細(xì)胞增殖和侵襲過程中的功能以及分子機(jī)制。